成都武侯祠如今前殿供奉刘备、后殿供奉诸葛亮的布局，并不是最初建成时的样子。
最早刘备的汉昭烈庙和诸葛亮的武侯祠是两处独立的纪念场所。把两处建筑合并在一起的人，是明代的朱椿王爷。
君臣合祀格局的由来
1391年，明蜀献王朱椿来到成都祭拜。他认为两座庙宇相邻却分开祭祀不合情理，秉持君臣宜一体的想法，臣子诸葛亮不应该单独接受香火，应当和君主刘备一同供奉。于是下令拆除原本独立的武侯祠，将诸葛亮塑像移入刘备的汉昭烈庙，奠定君臣合祀的基础。
前后殿的格局成型于清代
明末战乱，成都这片祠庙建筑群基本损毁。康熙十年也就是1671年，当地官员启动重建工程。 重建过程需要平衡两层诉求。礼制层面不能破坏君臣尊卑秩序，刘备所在的前殿，地基修得更高，建筑面积更大，体现君主地位。民间层面，诸葛亮在百姓心中声望极高，所以单独在后殿修建殿堂安放诸葛亮塑像。
由此形成前殿刘备、后殿诸葛亮的布局，也被概括为前殿如朝廷礼、后殿如家庭礼。建筑官方名称依旧是汉昭烈庙，但民间习惯一直称呼这里为武侯祠。
如今看到的整套布局，是明代出于君臣一体的理念，加上清代重建时兼顾礼制与民众情感，两重因素共同造就。
